Os fatores de risco e as causas que podem levar à deficiência intelectual podem ocorrer em três fases: pré-natais, perinatais e pós-natais.
• Pré-natais
• Perinatais
• Pós-natais
Também há fatores que incidem desde o momento da concepção do bebê até o início do trabalho de parto, os fatores genéticos, como:
• Alterações cromossômicas (numéricas ou estruturais): provocam, entre outras, a Síndrome de Down.
• Alterações gênicas (erros inatos do metabolismo): que provocam, entre outros problemas, a fenilcetonúria.